为进一步深化医疗卫生体制改革，2012年3月14日，国务院印发《“十二五”期间深化医药卫生体制改革规划暨实施方案》（以下简称《实施方案》），明确了2012—2015年医药卫生体制改革的阶段目标、改革重点和主要任务。规划中最大的亮点：到2015年，政府卫生投入增长幅度将高于经常性财政支出增长幅度，并实现个人卫生支出占卫生总费用的比例降低到30%以下，做到有效缓解“看病难、看病贵”的问题。
《实施方案》提出：加快健全全民医保体系；巩固扩大基本医保覆盖面；提高基本医疗保障水平；完善基本医保管理体制；提高基本医保管理服务水平；改革完善医保支付制度；完善城乡医疗救助制度；积极发展商业健康保险；探索建立重特大疾病保障机制。

同时，《实施方案》要求巩固完善基本药物制度和基层医疗卫生机构运行新机制，持续扩大基层医药卫生体制改革成效，巩固完善国家基本药物制度，深化基层医疗卫生机构管理体制、补偿机制、药品供应和人事分配等方面的综合改革，继续加强基层服务网络建设，加快建立全科医生制度，促进基层医疗卫生机构全面发展。

另外，《实施方案》提出积极推进公立医院改革，坚持公立医院公益性质，按照“四个分开”的要求，以破除“以药补医”机制为关键环节，以县级医院为重点，统筹推进管理体制、补偿机制、人事分配、药品供应、价格机制等方面的综合改革，由局部试点转向全面推进，大力开展便民惠民服务，逐步建立维护公益性、调动积极性、保障可持续的公立医院运行新机制。