改革进入攻坚期和深水区，面对艰巨复杂的改革任务和巨大的改革压力，2013年11月12日，中共十八届三中全会通过的《中国共产党第十八届中央委员会第三次全体会议公报》和《中共中央关于全面深化改革若干重大问题的决定》提出“中央成立全面深化改革领导小组，负责改革总体设计、统筹协调、整体推进、督促落实”。

2013年12月30日，中共中央政治局召开会议，决定成立由习近平任组长，李克强、刘云山、张高丽任副组长的中央全面深化改革领导小组。党和国家最高领导人亲自挂帅，成立全面深化改革领导小组，充分体现了中央对改革的高度重视和强烈决心。以前统筹各方面的改革主要由国家发改委来承担。国家发改委在制定发展战略，进行宏观管理上发挥了重大作用。但是由于改革的复杂性和紧迫性，以及加强各项改革统筹协调的必要性，国家发改委在一些方面尤其是政策的制定上受到局限。早在十八届三中全会文件起草期间，许多人提出，新一轮改革涉及的部门和领域更多、推进难度更大、触及利益更深，必须有一个更高层级、更强有力的领导“中枢”来加强顶层设计。全面深化改革领导小组的成立更具权威性，能够保证改革的设计、协调、推进和监督每一个环节的落实，有助于确保改革的系统性、整体性、协同性。 

在以习近平同志为核心的党中央的坚强领导下，中央全面深化改革领导小组全面发力、多点突破、纵深推进，经济体制和生态文明体制改革、民主法制领域改革、文化体制改革、社会体制改革、党的建设制度改革、纪律检查体制改革6个专项小组改革部署全面展开。截至2017年底，中央全面深化改革领导小组共召开39次会议，其中，十八届中央全面深化改革领导小组共召开38次会议。十九届中央全面深化改革领导小组召开1次会议，审议了17份文件。