卫生医疗体制从1998年开始推行“三项改革”，即医疗保险制度改革、医疗卫生体制改革、药品生产流通体制改革，2000年国务院专门召开会议就“三改并举”进行部署。2000年2月21日，国务院印发《关于城镇医药卫生体制改革的指导意见》，全面启动医改。此次医改主要措施包括：将医疗机构分为非营利性和营利性两类进行管理；扩大基本医疗保险制度覆盖面；卫生行政部门转变职能，政事分开，实行医疗机构分类管理；改革药品流通体制，实行医药分家等。这些措施被解读成为完全“市场化”的医改开了绿灯。7月7日，卫生部等5部门下发《医疗机构药品集中招标采购试点工作若干规定》，要求药品集中招标采购活动，一般实行公开招标。不宜实行公开招标的可采用邀请招标、竞争性谈判采购、询价采购等方式进行。
    7月18日，卫生部等4部门下发《关于城镇医疗机构分类管理的实施意见》，指出非营利性和营利性医疗机构按机构整体划分。划分的主要依据是医疗机构的经营目的、服务任务，以及执行不同的财政、税收、价格政策和财务会计制度。现有医疗机构性质的划分原则是：自愿选择和政府核定相结合；非营利性医疗机构在我国医疗服务体系中占主体和主导地位；符合区域卫生规划，优化卫生资源配置。8月4日，国家发展计划委员会、卫生部印发《关于改革医疗服务价格管理的意见》，就改革医疗服务价格管理提出5条意见：调整医疗服务价格管理形式；下放医疗服务价格管理权限；规范医疗服务价格项目；改进医疗服务价格管理方法；加强医疗服务价格监督检查。